公積金貸款逾期會補扣，一般會在還款日當天或者是第二天進行補扣，當然了這也需要客戶還款賬戶里面有足夠的資金。由于公積金貸款還款沒有寬限期，如果一客戶出現了連三累六這種比較嚴重的逾期行為的時候，公積金中心才會采取相應的行動。所以為了避免這些情況出現，客戶還是要保持良好的借還記錄，不要輕易逾期。

公積金貸款完成后，借款人需要按照公積金中心的規定來按時還款本息，直到還清所有欠款。公積金扣款會二次補扣，前提是首次扣款失敗。住房公積金扣款優先從公積金賬戶中扣除，如果公積金賬戶的余額不足以扣款，那么會從綁定的銀行卡中扣除還款本息。當公積金中心系統沒有主動扣款時，借款人可主動聯系客服完成二次扣款。

公積金二次扣款算不算逾期需要根據時間來確定。

1、 如果在還款日前完成二次扣款，那么不會算的逾期。公積金還款日也就是截止還款日期，如果在還款日當天收到了扣款失敗的短信，那么可以主動聯系客服二次劃扣，扣款成功后不會算作逾期。

2、 如果在還款日后二次扣款，因為超過了公積金還款日，那么會算作逾期。住房公積金逾期會產生罰息，同時還會上報到征信系統中，影響到個人信用。